Die FA Wind und Solar wird von Bund und Ländern, kommunalen Spitzenverbänden, Wirtschafts- und Naturschutzverbänden und Unternehmen der Energiewirtschaft getragen.

In der Mitgliederversammlung können alle ordentlichen Mitglieder ihre Belange einbringen und diskutieren und so die inhaltliche Arbeit der Fachagentur entscheidend mitgestalten. 

Die FA Wind und Solar wird zudem von fördernden Mitgliedern unterstützt. Sie bilden den Beirat, der den Vorstand und die Mitgliederversammlung berät.

Der gemeinnützige Verein wird durch den Vereinsvorstand geleitet und maßgeblich durch seine Mitglieder getragen.